Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT15P19012 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT15P19012 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT15P19012 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT15P19012 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT15P19012 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT15P19012 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT15P19012 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT15P19012 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT15P19012 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT15P19012 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT15P19012 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT15P19012 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT15P19012 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT15P19012 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT15P19012 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT15P19012 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT15P19012 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT15P19012 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT15P19012 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT15P19012 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT15P19012 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT15P19012 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT15P19012 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT15P19012 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT15P19012 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT15P19012 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT15P19012 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT15P19012 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT15P19012 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT15P19012 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT15P19012 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT15P19012 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT15P19012 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT15P19012 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT15P19012 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT15P19012 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT15P19012 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT15P19012 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT15P19012 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT15P19012 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT15P19012 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT15P19012 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT15P19012 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT15P19012 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT15P19012 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT15P19012 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT15P19012 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT15P19012 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT15P19012 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT15P19012 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT15P19012 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT15P19012 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT15P19012 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT15P19012 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT15P19012 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT15P19012 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT15P19012 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT15P19012 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT15P19012 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT15P19012 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT15P19012 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT15P19012 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT15P19012 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT15P19012 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT15P19012 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT15P19012 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT15P19012 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT15P19012 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT15P19012 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT15P19012 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT15P19012 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT15P19012 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT15P19012 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT15P19012 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT15P19012 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT15P19012 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT15P19012 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT15P19012 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT15P19012 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT15P19012 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT15P19012 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT15P19012 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT15P19012 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT15P19012 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT15P19012 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT15P19012 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT15P19012 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT15P19012 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT15P19012 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT15P19012 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT15P19012 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT15P19012 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT15P19012 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT15P19012 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT15P19012 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT15P19012 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT15P19012 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT15P19012 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT15P19012 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms