Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBPP18428 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBPP18428 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBPP18428 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBPP18428 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LBPP18428 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LBPP18428 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LBPP18428 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LBPP18428 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LBPP18428 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LBPP18428 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LBPP18428 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LBPP18428 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LBPP18428 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LBPP18428 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LBPP18428 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBPP18428 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBPP18428 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBPP18428 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBPP18428 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBPP18428 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBPP18428 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBPP18428 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBPP18428 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBPP18428 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBPP18428 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBPP18428 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBPP18428 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBPP18428 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBPP18428 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBPP18428 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBPP18428 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LBPP18428 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBPP18428 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBPP18428 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBPP18428 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBPP18428 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBPP18428 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBPP18428 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBPP18428 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBPP18428 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBPP18428 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBPP18428 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBPP18428 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBPP18428 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBPP18428 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBPP18428 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBPP18428 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBPP18428 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBPP18428 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBPP18428 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBPP18428 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBPP18428 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBPP18428 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBPP18428 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBPP18428 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBPP18428 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBPP18428 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LBPP18428 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LBPP18428 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LBPP18428 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LBPP18428 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LBPP18428 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LBPP18428 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LBPP18428 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LBPP18428 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LBPP18428 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LBPP18428 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LBPP18428 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LBPP18428 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LBPP18428 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LBPP18428 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LBPP18428 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LBPP18428 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LBPP18428 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LBPP18428 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LBPP18428 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LBPP18428 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LBPP18428 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LBPP18428 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LBPP18428 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LBPP18428 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LBPP18428 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LBPP18428 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LBPP18428 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LBPP18428 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LBPP18428 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LBPP18428 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LBPP18428 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LBPP18428 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LBPP18428 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LBPP18428 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LBPP18428 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LBPP18428 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LBPP18428 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LBPP18428 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LBPP18428 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LBPP18428 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LBPP18428 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LBPP18428 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms