Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPI1P17947 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPI1P17947 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPI1P17947 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPI1P17947 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPI1P17947 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPI1P17947 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPI1P17947 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPI1P17947 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPI1P17947 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPI1P17947 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPI1P17947 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPI1P17947 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPI1P17947 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPI1P17947 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPI1P17947 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPI1P17947 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPI1P17947 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPI1P17947 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPI1P17947 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPI1P17947 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPI1P17947 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPI1P17947 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SPI1P17947 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPI1P17947 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPI1P17947 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPI1P17947 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPI1P17947 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPI1P17947 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPI1P17947 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPI1P17947 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPI1P17947 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPI1P17947 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPI1P17947 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPI1P17947 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPI1P17947 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPI1P17947 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPI1P17947 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPI1P17947 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPI1P17947 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPI1P17947 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SPI1P17947 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPI1P17947 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPI1P17947 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPI1P17947 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SPI1P17947 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPI1P17947 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPI1P17947 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPI1P17947 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPI1P17947 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPI1P17947 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPI1P17947 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPI1P17947 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPI1P17947 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPI1P17947 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPI1P17947 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPI1P17947 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPI1P17947 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPI1P17947 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPI1P17947 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPI1P17947 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPI1P17947 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPI1P17947 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPI1P17947 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPI1P17947 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPI1P17947 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPI1P17947 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPI1P17947 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPI1P17947 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPI1P17947 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPI1P17947 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPI1P17947 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPI1P17947 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPI1P17947 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPI1P17947 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPI1P17947 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPI1P17947 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPI1P17947 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPI1P17947 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPI1P17947 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPI1P17947 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPI1P17947 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPI1P17947 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPI1P17947 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPI1P17947 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPI1P17947 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPI1P17947 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPI1P17947 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPI1P17947 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPI1P17947 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPI1P17947 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPI1P17947 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPI1P17947 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPI1P17947 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPI1P17947 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPI1P17947 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPI1P17947 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPI1P17947 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPI1P17947 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPI1P17947 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms