Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AMD1P17707 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMD1P17707 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMD1P17707 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMD1P17707 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMD1P17707 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMD1P17707 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMD1P17707 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMD1P17707 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMD1P17707 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMD1P17707 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMD1P17707 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMD1P17707 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMD1P17707 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMD1P17707 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMD1P17707 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMD1P17707 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AMD1P17707 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMD1P17707 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMD1P17707 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMD1P17707 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMD1P17707 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMD1P17707 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMD1P17707 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AMD1P17707 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AMD1P17707 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMD1P17707 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMD1P17707 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMD1P17707 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMD1P17707 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMD1P17707 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMD1P17707 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMD1P17707 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMD1P17707 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMD1P17707 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMD1P17707 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMD1P17707 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMD1P17707 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMD1P17707 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMD1P17707 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMD1P17707 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMD1P17707 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMD1P17707 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMD1P17707 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMD1P17707 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMD1P17707 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMD1P17707 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMD1P17707 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMD1P17707 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AMD1P17707 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMD1P17707 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMD1P17707 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMD1P17707 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMD1P17707 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMD1P17707 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMD1P17707 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMD1P17707 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMD1P17707 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMD1P17707 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMD1P17707 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMD1P17707 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMD1P17707 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMD1P17707 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMD1P17707 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AMD1P17707 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AMD1P17707 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AMD1P17707 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMD1P17707 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMD1P17707 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMD1P17707 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AMD1P17707 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMD1P17707 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMD1P17707 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMD1P17707 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMD1P17707 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMD1P17707 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMD1P17707 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMD1P17707 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMD1P17707 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMD1P17707 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMD1P17707 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AMD1P17707 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMD1P17707 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMD1P17707 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMD1P17707 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMD1P17707 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMD1P17707 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMD1P17707 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMD1P17707 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AMD1P17707 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMD1P17707 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMD1P17707 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMD1P17707 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMD1P17707 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMD1P17707 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMD1P17707 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMD1P17707 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMD1P17707 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMD1P17707 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMD1P17707 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms