Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB42P16452 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB42P16452 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB42P16452 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB42P16452 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPB42P16452 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPB42P16452 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPB42P16452 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPB42P16452 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPB42P16452 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB42P16452 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB42P16452 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB42P16452 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB42P16452 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB42P16452 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB42P16452 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB42P16452 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB42P16452 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB42P16452 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB42P16452 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB42P16452 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB42P16452 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB42P16452 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB42P16452 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB42P16452 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB42P16452 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB42P16452 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB42P16452 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB42P16452 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB42P16452 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB42P16452 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB42P16452 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB42P16452 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB42P16452 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB42P16452 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB42P16452 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB42P16452 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB42P16452 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB42P16452 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB42P16452 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB42P16452 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB42P16452 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB42P16452 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB42P16452 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB42P16452 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB42P16452 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB42P16452 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EPB42P16452 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB42P16452 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB42P16452 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB42P16452 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB42P16452 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB42P16452 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB42P16452 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB42P16452 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB42P16452 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB42P16452 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB42P16452 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB42P16452 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB42P16452 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB42P16452 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB42P16452 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB42P16452 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB42P16452 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB42P16452 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB42P16452 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB42P16452 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB42P16452 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB42P16452 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB42P16452 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB42P16452 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB42P16452 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB42P16452 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB42P16452 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB42P16452 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB42P16452 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB42P16452 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB42P16452 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB42P16452 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB42P16452 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB42P16452 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB42P16452 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB42P16452 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB42P16452 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB42P16452 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB42P16452 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB42P16452 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB42P16452 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB42P16452 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB42P16452 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB42P16452 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB42P16452 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB42P16452 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB42P16452 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB42P16452 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB42P16452 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB42P16452 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB42P16452 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB42P16452 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB42P16452 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms