Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRF1P14222 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRF1P14222 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRF1P14222 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRF1P14222 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRF1P14222 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRF1P14222 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRF1P14222 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRF1P14222 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRF1P14222 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRF1P14222 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRF1P14222 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRF1P14222 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRF1P14222 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRF1P14222 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRF1P14222 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRF1P14222 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRF1P14222 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRF1P14222 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRF1P14222 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRF1P14222 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRF1P14222 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRF1P14222 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRF1P14222 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRF1P14222 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRF1P14222 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRF1P14222 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRF1P14222 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRF1P14222 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRF1P14222 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRF1P14222 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRF1P14222 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRF1P14222 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRF1P14222 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRF1P14222 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRF1P14222 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRF1P14222 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRF1P14222 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRF1P14222 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRF1P14222 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PRF1P14222 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRF1P14222 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRF1P14222 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRF1P14222 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRF1P14222 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRF1P14222 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRF1P14222 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRF1P14222 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRF1P14222 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRF1P14222 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRF1P14222 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRF1P14222 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRF1P14222 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRF1P14222 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRF1P14222 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRF1P14222 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRF1P14222 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRF1P14222 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRF1P14222 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRF1P14222 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRF1P14222 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRF1P14222 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRF1P14222 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRF1P14222 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRF1P14222 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRF1P14222 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRF1P14222 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRF1P14222 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRF1P14222 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRF1P14222 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRF1P14222 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRF1P14222 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRF1P14222 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRF1P14222 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRF1P14222 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRF1P14222 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRF1P14222 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRF1P14222 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRF1P14222 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRF1P14222 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRF1P14222 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRF1P14222 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRF1P14222 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRF1P14222 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRF1P14222 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRF1P14222 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRF1P14222 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRF1P14222 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRF1P14222 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRF1P14222 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRF1P14222 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRF1P14222 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRF1P14222 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRF1P14222 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRF1P14222 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRF1P14222 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRF1P14222 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRF1P14222 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRF1P14222 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRF1P14222 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms