Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRG2P13727 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRG2P13727 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRG2P13727 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRG2P13727 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRG2P13727 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRG2P13727 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRG2P13727 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRG2P13727 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRG2P13727 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRG2P13727 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRG2P13727 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRG2P13727 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRG2P13727 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRG2P13727 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRG2P13727 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRG2P13727 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRG2P13727 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRG2P13727 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRG2P13727 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRG2P13727 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRG2P13727 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRG2P13727 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRG2P13727 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRG2P13727 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRG2P13727 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRG2P13727 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRG2P13727 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRG2P13727 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRG2P13727 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRG2P13727 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRG2P13727 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRG2P13727 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRG2P13727 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRG2P13727 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRG2P13727 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRG2P13727 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRG2P13727 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRG2P13727 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRG2P13727 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRG2P13727 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRG2P13727 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRG2P13727 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRG2P13727 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRG2P13727 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRG2P13727 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRG2P13727 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRG2P13727 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRG2P13727 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRG2P13727 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRG2P13727 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRG2P13727 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRG2P13727 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRG2P13727 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRG2P13727 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRG2P13727 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRG2P13727 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRG2P13727 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRG2P13727 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRG2P13727 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRG2P13727 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRG2P13727 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRG2P13727 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRG2P13727 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRG2P13727 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRG2P13727 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRG2P13727 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRG2P13727 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRG2P13727 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRG2P13727 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRG2P13727 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRG2P13727 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRG2P13727 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRG2P13727 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRG2P13727 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRG2P13727 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRG2P13727 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PRG2P13727 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRG2P13727 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRG2P13727 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRG2P13727 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRG2P13727 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRG2P13727 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRG2P13727 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRG2P13727 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRG2P13727 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRG2P13727 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRG2P13727 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRG2P13727 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRG2P13727 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRG2P13727 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRG2P13727 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRG2P13727 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRG2P13727 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRG2P13727 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRG2P13727 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRG2P13727 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRG2P13727 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PRG2P13727 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRG2P13727 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms