Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf88P0DMB2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms