Protein–RNA interactions for Protein: P0DKB5

TPBGL, Trophoblast glycoprotein-like, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGLP0DKB5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPBGLP0DKB5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPBGLP0DKB5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPBGLP0DKB5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms