Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RD3LP0DJH9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RD3LP0DJH9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms