Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2MP0CAP2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR2MP0CAP2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2MP0CAP2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms