Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS17P08708 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS17P08708 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS17P08708 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS17P08708 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS17P08708 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS17P08708 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS17P08708 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS17P08708 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS17P08708 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS17P08708 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS17P08708 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS17P08708 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS17P08708 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS17P08708 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS17P08708 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS17P08708 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS17P08708 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS17P08708 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS17P08708 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS17P08708 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS17P08708 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS17P08708 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS17P08708 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS17P08708 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS17P08708 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS17P08708 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS17P08708 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS17P08708 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS17P08708 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS17P08708 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS17P08708 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS17P08708 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS17P08708 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS17P08708 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS17P08708 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS17P08708 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS17P08708 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS17P08708 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS17P08708 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS17P08708 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS17P08708 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS17P08708 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS17P08708 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS17P08708 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS17P08708 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS17P08708 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS17P08708 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS17P08708 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS17P08708 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS17P08708 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS17P08708 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS17P08708 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS17P08708 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS17P08708 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS17P08708 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS17P08708 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS17P08708 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS17P08708 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPS17P08708 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS17P08708 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS17P08708 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS17P08708 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS17P08708 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS17P08708 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS17P08708 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS17P08708 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS17P08708 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS17P08708 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS17P08708 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS17P08708 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS17P08708 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS17P08708 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS17P08708 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS17P08708 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS17P08708 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS17P08708 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS17P08708 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS17P08708 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS17P08708 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS17P08708 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS17P08708 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS17P08708 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS17P08708 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS17P08708 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS17P08708 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS17P08708 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS17P08708 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS17P08708 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS17P08708 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS17P08708 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS17P08708 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS17P08708 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS17P08708 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS17P08708 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS17P08708 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS17P08708 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS17P08708 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS17P08708 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS17P08708 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms