Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRM2P04554 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRM2P04554 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRM2P04554 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRM2P04554 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRM2P04554 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRM2P04554 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRM2P04554 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRM2P04554 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRM2P04554 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRM2P04554 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRM2P04554 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRM2P04554 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRM2P04554 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRM2P04554 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRM2P04554 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRM2P04554 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRM2P04554 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRM2P04554 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRM2P04554 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRM2P04554 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRM2P04554 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRM2P04554 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRM2P04554 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRM2P04554 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRM2P04554 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRM2P04554 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRM2P04554 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRM2P04554 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRM2P04554 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRM2P04554 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRM2P04554 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRM2P04554 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRM2P04554 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRM2P04554 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRM2P04554 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRM2P04554 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRM2P04554 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PRM2P04554 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRM2P04554 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PRM2P04554 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRM2P04554 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRM2P04554 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRM2P04554 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRM2P04554 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRM2P04554 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRM2P04554 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRM2P04554 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRM2P04554 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRM2P04554 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRM2P04554 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRM2P04554 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRM2P04554 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRM2P04554 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PRM2P04554 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRM2P04554 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRM2P04554 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRM2P04554 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PRM2P04554 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRM2P04554 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRM2P04554 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRM2P04554 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRM2P04554 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRM2P04554 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRM2P04554 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRM2P04554 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRM2P04554 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRM2P04554 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRM2P04554 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRM2P04554 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRM2P04554 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRM2P04554 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRM2P04554 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRM2P04554 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRM2P04554 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRM2P04554 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRM2P04554 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRM2P04554 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRM2P04554 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRM2P04554 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRM2P04554 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRM2P04554 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRM2P04554 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRM2P04554 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRM2P04554 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRM2P04554 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRM2P04554 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRM2P04554 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRM2P04554 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRM2P04554 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRM2P04554 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRM2P04554 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRM2P04554 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRM2P04554 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRM2P04554 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRM2P04554 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRM2P04554 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRM2P04554 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRM2P04554 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRM2P04554 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms