Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHBGP04278 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHBGP04278 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHBGP04278 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHBGP04278 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHBGP04278 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHBGP04278 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHBGP04278 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHBGP04278 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHBGP04278 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHBGP04278 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHBGP04278 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHBGP04278 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHBGP04278 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHBGP04278 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHBGP04278 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHBGP04278 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHBGP04278 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SHBGP04278 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SHBGP04278 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHBGP04278 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHBGP04278 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHBGP04278 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHBGP04278 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHBGP04278 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHBGP04278 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHBGP04278 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHBGP04278 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHBGP04278 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHBGP04278 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHBGP04278 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHBGP04278 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHBGP04278 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHBGP04278 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHBGP04278 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHBGP04278 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHBGP04278 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHBGP04278 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHBGP04278 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHBGP04278 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SHBGP04278 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBGP04278 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBGP04278 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBGP04278 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBGP04278 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBGP04278 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBGP04278 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBGP04278 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBGP04278 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBGP04278 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBGP04278 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBGP04278 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBGP04278 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBGP04278 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHBGP04278 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHBGP04278 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHBGP04278 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHBGP04278 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHBGP04278 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHBGP04278 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHBGP04278 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHBGP04278 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHBGP04278 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHBGP04278 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBGP04278 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBGP04278 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBGP04278 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBGP04278 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBGP04278 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBGP04278 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBGP04278 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBGP04278 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBGP04278 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBGP04278 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBGP04278 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBGP04278 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBGP04278 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBGP04278 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBGP04278 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBGP04278 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBGP04278 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBGP04278 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBGP04278 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBGP04278 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBGP04278 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBGP04278 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBGP04278 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBGP04278 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBGP04278 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBGP04278 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBGP04278 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBGP04278 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBGP04278 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBGP04278 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBGP04278 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBGP04278 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBGP04278 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBGP04278 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHBGP04278 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHBGP04278 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms