Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX3O75364 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX3O75364 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX3O75364 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX3O75364 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX3O75364 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX3O75364 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX3O75364 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX3O75364 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX3O75364 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX3O75364 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITX3O75364 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX3O75364 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX3O75364 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX3O75364 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX3O75364 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX3O75364 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX3O75364 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX3O75364 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX3O75364 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX3O75364 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX3O75364 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX3O75364 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX3O75364 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX3O75364 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX3O75364 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX3O75364 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX3O75364 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX3O75364 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX3O75364 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX3O75364 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX3O75364 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX3O75364 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX3O75364 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX3O75364 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX3O75364 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX3O75364 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX3O75364 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX3O75364 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX3O75364 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX3O75364 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX3O75364 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX3O75364 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX3O75364 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX3O75364 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX3O75364 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX3O75364 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX3O75364 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX3O75364 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX3O75364 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX3O75364 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX3O75364 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX3O75364 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX3O75364 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX3O75364 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX3O75364 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX3O75364 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX3O75364 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX3O75364 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX3O75364 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX3O75364 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX3O75364 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX3O75364 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX3O75364 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX3O75364 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX3O75364 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX3O75364 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX3O75364 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX3O75364 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX3O75364 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITX3O75364 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX3O75364 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX3O75364 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX3O75364 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX3O75364 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX3O75364 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX3O75364 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX3O75364 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX3O75364 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX3O75364 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX3O75364 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX3O75364 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX3O75364 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX3O75364 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX3O75364 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX3O75364 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX3O75364 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX3O75364 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX3O75364 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX3O75364 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX3O75364 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX3O75364 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX3O75364 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX3O75364 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX3O75364 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX3O75364 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX3O75364 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX3O75364 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX3O75364 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX3O75364 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms