Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA4O75335 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA4O75335 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA4O75335 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms