Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP9AO75110 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP9AO75110 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms