Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX2O60749 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX2O60749 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX2O60749 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX2O60749 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX2O60749 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX2O60749 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX2O60749 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX2O60749 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX2O60749 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX2O60749 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX2O60749 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX2O60749 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX2O60749 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX2O60749 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX2O60749 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX2O60749 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX2O60749 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX2O60749 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX2O60749 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX2O60749 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX2O60749 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX2O60749 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX2O60749 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX2O60749 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX2O60749 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX2O60749 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX2O60749 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX2O60749 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX2O60749 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX2O60749 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX2O60749 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX2O60749 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX2O60749 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX2O60749 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX2O60749 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX2O60749 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX2O60749 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX2O60749 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX2O60749 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX2O60749 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX2O60749 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX2O60749 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX2O60749 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX2O60749 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX2O60749 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX2O60749 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX2O60749 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX2O60749 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX2O60749 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX2O60749 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX2O60749 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX2O60749 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX2O60749 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX2O60749 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX2O60749 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX2O60749 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX2O60749 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX2O60749 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX2O60749 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX2O60749 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX2O60749 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX2O60749 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX2O60749 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX2O60749 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX2O60749 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX2O60749 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX2O60749 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX2O60749 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX2O60749 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX2O60749 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX2O60749 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX2O60749 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX2O60749 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX2O60749 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX2O60749 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX2O60749 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX2O60749 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX2O60749 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX2O60749 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX2O60749 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX2O60749 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX2O60749 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX2O60749 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX2O60749 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX2O60749 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX2O60749 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX2O60749 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX2O60749 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX2O60749 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX2O60749 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX2O60749 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX2O60749 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX2O60749 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX2O60749 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX2O60749 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX2O60749 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX2O60749 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX2O60749 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX2O60749 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms