Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLR5O60602 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLR5O60602 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLR5O60602 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLR5O60602 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLR5O60602 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLR5O60602 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLR5O60602 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLR5O60602 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TLR5O60602 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TLR5O60602 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TLR5O60602 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TLR5O60602 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TLR5O60602 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TLR5O60602 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TLR5O60602 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TLR5O60602 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TLR5O60602 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TLR5O60602 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TLR5O60602 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TLR5O60602 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TLR5O60602 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TLR5O60602 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TLR5O60602 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TLR5O60602 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TLR5O60602 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TLR5O60602 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TLR5O60602 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLR5O60602 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLR5O60602 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLR5O60602 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLR5O60602 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLR5O60602 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TLR5O60602 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLR5O60602 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLR5O60602 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLR5O60602 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLR5O60602 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLR5O60602 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLR5O60602 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLR5O60602 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLR5O60602 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLR5O60602 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TLR5O60602 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLR5O60602 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLR5O60602 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLR5O60602 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLR5O60602 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TLR5O60602 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLR5O60602 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLR5O60602 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLR5O60602 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLR5O60602 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLR5O60602 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLR5O60602 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLR5O60602 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLR5O60602 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TLR5O60602 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TLR5O60602 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TLR5O60602 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TLR5O60602 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TLR5O60602 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TLR5O60602 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TLR5O60602 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TLR5O60602 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TLR5O60602 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TLR5O60602 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLR5O60602 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLR5O60602 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TLR5O60602 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLR5O60602 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLR5O60602 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLR5O60602 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TLR5O60602 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLR5O60602 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLR5O60602 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLR5O60602 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLR5O60602 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLR5O60602 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TLR5O60602 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TLR5O60602 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TLR5O60602 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TLR5O60602 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TLR5O60602 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TLR5O60602 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TLR5O60602 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TLR5O60602 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TLR5O60602 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TLR5O60602 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TLR5O60602 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TLR5O60602 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TLR5O60602 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TLR5O60602 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TLR5O60602 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TLR5O60602 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TLR5O60602 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TLR5O60602 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TLR5O60602 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TLR5O60602 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TLR5O60602 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms