Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STX6O43752 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
STX6O43752 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STX6O43752 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STX6O43752 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STX6O43752 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STX6O43752 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STX6O43752 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STX6O43752 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STX6O43752 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
STX6O43752 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STX6O43752 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
STX6O43752 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
STX6O43752 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
STX6O43752 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
STX6O43752 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STX6O43752 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STX6O43752 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
STX6O43752 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STX6O43752 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STX6O43752 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STX6O43752 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STX6O43752 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STX6O43752 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STX6O43752 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STX6O43752 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
STX6O43752 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STX6O43752 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STX6O43752 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
STX6O43752 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STX6O43752 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STX6O43752 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STX6O43752 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STX6O43752 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STX6O43752 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
STX6O43752 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STX6O43752 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STX6O43752 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STX6O43752 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STX6O43752 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STX6O43752 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STX6O43752 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STX6O43752 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
STX6O43752 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STX6O43752 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STX6O43752 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STX6O43752 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STX6O43752 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
STX6O43752 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
STX6O43752 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
STX6O43752 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STX6O43752 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STX6O43752 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STX6O43752 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STX6O43752 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STX6O43752 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STX6O43752 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STX6O43752 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STX6O43752 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STX6O43752 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STX6O43752 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STX6O43752 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STX6O43752 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STX6O43752 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STX6O43752 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STX6O43752 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STX6O43752 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STX6O43752 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STX6O43752 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STX6O43752 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STX6O43752 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STX6O43752 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STX6O43752 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STX6O43752 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
STX6O43752 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STX6O43752 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STX6O43752 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STX6O43752 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STX6O43752 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STX6O43752 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STX6O43752 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STX6O43752 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
STX6O43752 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STX6O43752 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STX6O43752 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STX6O43752 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STX6O43752 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STX6O43752 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STX6O43752 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STX6O43752 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
STX6O43752 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
STX6O43752 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
STX6O43752 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
STX6O43752 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
STX6O43752 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.84
STX6O43752 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STX6O43752 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STX6O43752 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STX6O43752 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
STX6O43752 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms