Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP8B1O43520 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP8B1O43520 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP8B1O43520 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms