Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TBX1O43435 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TBX1O43435 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TBX1O43435 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TBX1O43435 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TBX1O43435 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TBX1O43435 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TBX1O43435 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TBX1O43435 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TBX1O43435 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TBX1O43435 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TBX1O43435 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TBX1O43435 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TBX1O43435 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBX1O43435 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBX1O43435 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBX1O43435 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBX1O43435 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TBX1O43435 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBX1O43435 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBX1O43435 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBX1O43435 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBX1O43435 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBX1O43435 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TBX1O43435 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBX1O43435 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBX1O43435 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBX1O43435 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBX1O43435 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBX1O43435 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TBX1O43435 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBX1O43435 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TBX1O43435 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBX1O43435 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBX1O43435 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBX1O43435 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBX1O43435 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBX1O43435 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBX1O43435 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBX1O43435 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBX1O43435 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBX1O43435 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBX1O43435 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBX1O43435 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBX1O43435 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBX1O43435 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBX1O43435 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBX1O43435 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBX1O43435 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBX1O43435 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBX1O43435 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBX1O43435 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBX1O43435 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBX1O43435 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TBX1O43435 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBX1O43435 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBX1O43435 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBX1O43435 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBX1O43435 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBX1O43435 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBX1O43435 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBX1O43435 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBX1O43435 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TBX1O43435 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBX1O43435 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBX1O43435 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBX1O43435 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBX1O43435 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBX1O43435 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TBX1O43435 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TBX1O43435 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TBX1O43435 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TBX1O43435 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TBX1O43435 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TBX1O43435 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TBX1O43435 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TBX1O43435 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TBX1O43435 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TBX1O43435 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TBX1O43435 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TBX1O43435 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TBX1O43435 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TBX1O43435 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBX1O43435 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBX1O43435 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBX1O43435 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBX1O43435 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBX1O43435 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBX1O43435 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBX1O43435 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBX1O43435 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBX1O43435 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBX1O43435 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBX1O43435 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBX1O43435 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBX1O43435 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBX1O43435 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TBX1O43435 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TBX1O43435 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TBX1O43435 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms