Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA2O43364 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXA2O43364 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA2O43364 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA2O43364 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA2O43364 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA2O43364 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA2O43364 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA2O43364 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA2O43364 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA2O43364 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA2O43364 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA2O43364 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA2O43364 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA2O43364 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA2O43364 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA2O43364 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA2O43364 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA2O43364 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA2O43364 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms