Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PLXNB1O43157 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PLXNB1O43157 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLXNB1O43157 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms