Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHADO15335 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHADO15335 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHADO15335 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHADO15335 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHADO15335 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHADO15335 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHADO15335 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHADO15335 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHADO15335 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHADO15335 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHADO15335 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHADO15335 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHADO15335 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHADO15335 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHADO15335 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHADO15335 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHADO15335 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHADO15335 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHADO15335 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHADO15335 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHADO15335 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHADO15335 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHADO15335 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHADO15335 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHADO15335 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHADO15335 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHADO15335 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHADO15335 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHADO15335 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHADO15335 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHADO15335 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHADO15335 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHADO15335 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHADO15335 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHADO15335 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHADO15335 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHADO15335 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHADO15335 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHADO15335 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHADO15335 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHADO15335 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHADO15335 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHADO15335 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHADO15335 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHADO15335 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHADO15335 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHADO15335 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHADO15335 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHADO15335 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHADO15335 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHADO15335 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHADO15335 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHADO15335 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHADO15335 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHADO15335 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHADO15335 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHADO15335 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHADO15335 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHADO15335 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHADO15335 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHADO15335 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHADO15335 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHADO15335 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHADO15335 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHADO15335 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHADO15335 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHADO15335 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHADO15335 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHADO15335 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHADO15335 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHADO15335 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHADO15335 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHADO15335 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHADO15335 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHADO15335 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHADO15335 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHADO15335 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHADO15335 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHADO15335 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHADO15335 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHADO15335 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHADO15335 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHADO15335 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHADO15335 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHADO15335 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHADO15335 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHADO15335 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHADO15335 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHADO15335 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHADO15335 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHADO15335 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHADO15335 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHADO15335 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHADO15335 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHADO15335 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHADO15335 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHADO15335 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHADO15335 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHADO15335 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms