Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNPHO15079 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNPHO15079 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNPHO15079 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNPHO15079 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNPHO15079 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNPHO15079 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNPHO15079 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNPHO15079 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNPHO15079 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNPHO15079 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNPHO15079 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNPHO15079 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNPHO15079 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNPHO15079 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNPHO15079 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNPHO15079 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNPHO15079 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNPHO15079 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNPHO15079 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNPHO15079 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNPHO15079 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNPHO15079 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNPHO15079 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SNPHO15079 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNPHO15079 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNPHO15079 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNPHO15079 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNPHO15079 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNPHO15079 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNPHO15079 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNPHO15079 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNPHO15079 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNPHO15079 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNPHO15079 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNPHO15079 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNPHO15079 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNPHO15079 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNPHO15079 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNPHO15079 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNPHO15079 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNPHO15079 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNPHO15079 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SNPHO15079 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNPHO15079 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNPHO15079 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNPHO15079 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNPHO15079 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNPHO15079 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNPHO15079 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNPHO15079 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNPHO15079 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNPHO15079 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNPHO15079 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNPHO15079 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNPHO15079 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNPHO15079 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNPHO15079 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNPHO15079 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SNPHO15079 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNPHO15079 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNPHO15079 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNPHO15079 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNPHO15079 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNPHO15079 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNPHO15079 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNPHO15079 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNPHO15079 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNPHO15079 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNPHO15079 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNPHO15079 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNPHO15079 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNPHO15079 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNPHO15079 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNPHO15079 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNPHO15079 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNPHO15079 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNPHO15079 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNPHO15079 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNPHO15079 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNPHO15079 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNPHO15079 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNPHO15079 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNPHO15079 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SNPHO15079 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNPHO15079 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNPHO15079 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNPHO15079 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNPHO15079 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNPHO15079 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNPHO15079 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNPHO15079 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNPHO15079 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNPHO15079 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNPHO15079 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNPHO15079 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNPHO15079 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNPHO15079 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNPHO15079 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNPHO15079 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms