Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F3O00716 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F3O00716 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F3O00716 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F3O00716 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F3O00716 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F3O00716 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F3O00716 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F3O00716 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F3O00716 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F3O00716 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F3O00716 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F3O00716 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F3O00716 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F3O00716 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F3O00716 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F3O00716 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F3O00716 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F3O00716 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F3O00716 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F3O00716 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F3O00716 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F3O00716 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F3O00716 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F3O00716 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F3O00716 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F3O00716 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F3O00716 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F3O00716 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F3O00716 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F3O00716 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F3O00716 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F3O00716 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F3O00716 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F3O00716 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F3O00716 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F3O00716 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F3O00716 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F3O00716 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F3O00716 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F3O00716 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F3O00716 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F3O00716 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F3O00716 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F3O00716 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F3O00716 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F3O00716 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F3O00716 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F3O00716 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F3O00716 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F3O00716 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F3O00716 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F3O00716 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F3O00716 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F3O00716 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F3O00716 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F3O00716 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F3O00716 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F3O00716 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F3O00716 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F3O00716 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F3O00716 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F3O00716 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F3O00716 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F3O00716 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F3O00716 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F3O00716 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F3O00716 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F3O00716 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F3O00716 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F3O00716 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F3O00716 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F3O00716 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F3O00716 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F3O00716 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F3O00716 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F3O00716 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F3O00716 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F3O00716 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F3O00716 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F3O00716 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F3O00716 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F3O00716 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F3O00716 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F3O00716 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F3O00716 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F3O00716 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F3O00716 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F3O00716 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F3O00716 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F3O00716 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F3O00716 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F3O00716 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F3O00716 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F3O00716 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F3O00716 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F3O00716 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F3O00716 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F3O00716 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F3O00716 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms