Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM38O00635 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRIM38O00635 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM38O00635 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM38O00635 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms