Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA3O00505 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KPNA3O00505 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms