Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN8O00124 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBXN8O00124 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms