Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
I3L3M4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
I3L3M4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
I3L3M4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
I3L3M4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
I3L3M4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
I3L3M4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
I3L3M4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
I3L3M4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
I3L3M4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
I3L3M4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
I3L3M4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
I3L3M4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
I3L3M4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
I3L3M4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
I3L3M4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
I3L3M4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
I3L3M4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
I3L3M4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
I3L3M4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
I3L3M4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
I3L3M4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
I3L3M4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
I3L3M4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
I3L3M4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
I3L3M4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
I3L3M4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
I3L3M4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
I3L3M4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
I3L3M4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
I3L3M4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
I3L3M4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
I3L3M4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
I3L3M4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
I3L3M4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
I3L3M4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
I3L3M4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
I3L3M4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
I3L3M4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
I3L3M4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
I3L3M4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
I3L3M4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
I3L3M4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
I3L3M4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
I3L3M4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
I3L3M4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
I3L3M4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
I3L3M4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
I3L3M4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
I3L3M4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
I3L3M4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
I3L3M4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
I3L3M4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
I3L3M4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
I3L3M4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
I3L3M4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
I3L3M4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
I3L3M4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
I3L3M4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
I3L3M4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
I3L3M4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
I3L3M4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
I3L3M4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
I3L3M4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
I3L3M4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
I3L3M4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
I3L3M4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
I3L3M4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
I3L3M4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
I3L3M4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
I3L3M4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
I3L3M4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
I3L3M4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
I3L3M4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
I3L3M4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
I3L3M4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
I3L3M4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
I3L3M4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
I3L3M4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
I3L3M4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
I3L3M4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
I3L3M4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
I3L3M4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
I3L3M4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
I3L3M4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
I3L3M4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
I3L3M4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
I3L3M4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
I3L3M4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
I3L3M4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
I3L3M4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
I3L3M4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
I3L3M4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
I3L3M4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
I3L3M4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
I3L3M4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
I3L3M4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
I3L3M4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
I3L3M4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
I3L3M4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms