Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PATL2C9JE40 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PATL2C9JE40 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms