Protein–RNA interactions for Protein: B9A014

C21orf140, Uncharacterized protein C21orf140, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf140B9A014 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C21orf140B9A014 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C21orf140B9A014 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms