Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOLGA6BA6NDN3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms