Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN8

Uncharacterized protein ENSP00000372125, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NCN8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NCN8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NCN8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NCN8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NCN8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NCN8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NCN8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NCN8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NCN8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NCN8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NCN8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NCN8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NCN8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A6NCN8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A6NCN8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NCN8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NCN8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NCN8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NCN8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NCN8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NCN8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NCN8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NCN8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NCN8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NCN8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NCN8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NCN8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NCN8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NCN8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NCN8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NCN8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NCN8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NCN8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NCN8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NCN8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NCN8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NCN8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NCN8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NCN8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NCN8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NCN8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NCN8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NCN8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NCN8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NCN8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NCN8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NCN8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NCN8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NCN8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NCN8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NCN8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NCN8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NCN8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NCN8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NCN8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A6NCN8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NCN8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NCN8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NCN8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NCN8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NCN8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NCN8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NCN8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NCN8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NCN8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A6NCN8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
A6NCN8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NCN8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NCN8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NCN8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NCN8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NCN8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NCN8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NCN8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NCN8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A6NCN8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NCN8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NCN8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NCN8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NCN8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NCN8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NCN8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A6NCN8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NCN8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NCN8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NCN8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NCN8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NCN8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NCN8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A6NCN8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NCN8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NCN8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NCN8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NCN8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NCN8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NCN8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NCN8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NCN8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NCN8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NCN8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms