Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA6A0AVT1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA6A0AVT1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms