Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLIP2Q9UDT6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLIP2Q9UDT6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms