Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD5Q9P267 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms