Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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