Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN4Q9NRR5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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