Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC3GQ9HC16 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms