Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms