Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBB2BQ9BVA1 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB2BQ9BVA1 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms