Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRIMPOLQ96LW4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms