Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
UBE2E2Q96LR5 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms