Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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