Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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