Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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GEN1Q17RS7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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GEN1Q17RS7 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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GEN1Q17RS7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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GEN1Q17RS7 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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GEN1Q17RS7 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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GEN1Q17RS7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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