Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms