Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTRK3Q16288 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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